Nesimi Kalkan, 1992 yılında Cizîr’de tutuklandı ve yargılandığı Devlet Güvenlik Mahkemesi (DGM) tarafından “ülkenin birliğini ve bütünlüğünü bozma” iddiasıyla müebbet hapis cezasına mahkum edildi.
İnsan Hakları Derneği’nin (İHD) hasta tutsaklar listesinde yer alan Kalkan, tutsaklığı boyunca Bursa, Edirne, Tarsus, Silifke, Tekirdağ, Dîlok, Amed, Şirnex, Mêrdîn ve Erzirom cezaevlerinde kaldı.
Tutsaklığının sürdüğü son cezaevi olan Tarsus T Tipi Kapalı Cezaevi’nden tahliye edilen Kalkan, memleketi Cizîr ilçesinin Bazift köyünde kitlesel olarak karşılandı.